发现后大脑与活体大脑中 RNA 编辑的关键差异

在《自然通讯》最近的一项研究中，研究人员检查了后和活体前额叶皮质组织的腺苷到肌苷 (A-to-I) 核苷编辑。

研究人员发现，后脑组织中的 RNA 编辑水平明显高于活体组织。该研究的共同资深作者、伊坎西奈山精神病学、遗传和基因组科学、神经科学和神经外科副教授、活体大脑项目联合负责人 Alexander W. Charney 医学博士表示：“了解这些差异有助于通过 RNA 编辑修饰的视角提高我们对大脑功能和疾病的认识，从而有可能带来更好的诊断和治疗方法。”

研究：人类后和活体大脑中 A-to-I 编辑的不同情况。图片来源：steph photographies/Shutterstock.com

背景

最近关于缺血暴露引起的分子改变的研究帮助我们掌握了哺乳动物大脑中腺苷到肌苷的编辑。来自活体人类捐献者的新鲜脑组织可以消除后组织分析的混淆，从而实现更准确的检查。

腺苷到肌苷的编辑对于中枢神经系统的功能至关重要，错误的控制会导致神经系统疾病。脱氧核糖核酸 (DNA) 在后很长一段时间内都很稳定，但核糖核酸 (RNA) 则更容易受到破坏。区分活体和后中枢神经系统 (CNS) 组织对于理解脑部疾病和衰老至关重要。

关于研究

本研究调查了人类活体和后背外侧前额叶皮质 (DLPFC) 中腺苷到肌苷的编辑变化。

研究人员提出，缺血暴露的分子反应和先天免疫反应可能会改变后大脑中腺苷到肌苷的编辑情况。他们利用活体大脑计划 (LBP) 数据，研究了后和活体 DLPFC 组织对Alu编辑活动的影响。他们分析了 1 名活着的个体和 233 个部分匹配的后 DLPFC 样本的基因数据。他们为每个研究样本计算了一个Alu编辑指数 (AEI)。

研究人员进行了一项转录组范围的比较研究，以确定全球范围内的Alu编辑变异有多少是由生物和技术变量解释的。他们进行了两项进一步的研究，以调查 PMI 和 RNA 降解变化对活体和后组织中Alu编辑的影响。

研究人员研究了活体和后 DLPFC 样本中的 RNA 编辑情况，对来自 21 个后组织和 31 个活体组织的 206,568 个单核进行了测序。他们还为每个供体的每种细胞类型创建了伪批量池，并检查了活体和后 DLPFC 中作用于 RNA 的腺苷脱氨酶 (ADAR) 酶的表达情况。他们使用两种互补的位点调用方法和广泛的基于检测的标准对高置信度 RNA 位点进行了分类，以防止出现假阳性。

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