新软件工具解码免疫细胞的细胞因子语言

耶鲁大学的新研究揭示了复杂的细胞通信系统，该系统允许免疫细胞对感染和癌症做出反应。这项发表在《自然方法》杂志上的研究揭示了不同的细胞如何利用细胞因子相互交谈以形成免疫反应。

耶鲁大学团队使用基于因果推理框架 CINEMA-OT 的新计算方法，研究了单个免疫细胞如何对细胞因子组合或调节炎症的细胞释放的小蛋白质做出反应。他们发现某些细胞因子具有协同效应，与它们的单独效应相比，可诱导独特的基因激活程序。这种细胞因子信号的密码学充当一种语言，指导免疫细胞。

研究人员还利用实验室培养的人类肺组织，应用 CINEMA-OT 来研究人类呼吸道在接触普通感冒病、香雾或两者时的反应。分析显示，在香雾存在的情况下，各个细胞对病感染的反应不同，雾会抑制许多细胞类型的抗病防御。

“跟踪细胞反应具有挑战性，因为测量细胞的过程具有破坏性。为了解决这个问题，我们利用因果推理的思想构建了一种新算法，以在实验条件之间匹配细胞并推断细胞如何响应信号，”该论文的资深作者说David van Dijk 博士，医学和计算机科学助理教授。

van Dijk 继续说道：“这项研究中使用的技术是作为开源软件开发的，供社区使用，为蜂窝通信提供了前所未有的窗口。”

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